Генпрокуратура Росії визнала «Медузу» небажаною організацією. У своїй заяві вона стверджує, що «Медуза» «становить небезпеку для конституційного порядку та безпеки Російської Федерації». Проте у заяві не сказано, в чому саме полягає небезпека.
Кримінальна справа тепер загрожує співробітникам видання і читачам, які жертвували гроші на його роботу. Вона передбачає позбавлення волі до 10 років, а поширення чи вподобання робіт «Медузи» в соцмережах може розглядатися як адміністративне чи кримінальне правопорушення.
2021 року Росія внесла видання до реєстру «іноагентів», зобов’язавши маркувати статті, які б наголошували на цьому. Після оголошення «Медузи» «небажаною» маркування прибрали зі сайту та інших платформ. Наразі видання вже 8 років перебуває в Латвії.
«Медуза» зазначає, що продовжуватиме свою роботу, зокрема з англомовною версією видання. Наразі редакція шукає інструменти, які можуть допомогти у забезпеченні кібербезпеки чи обході інтернет-цензури.